Átfogó hálózattal 3 kikötők, Uganda hatalmas tengeri infrastruktúrával büszkélkedhet. Kulcscsillapítók, mint Fort Portal (UG), Kampala, Mbale fontos szerepet játszanak a kereskedelem hatalmas volumenének kezelésében, különféle logisztikai lehetőségeket kínálnak, és biztosítják a rugalmas kapcsolatot a nemzetközi hajózási útvonalakkal szerte a világon.