Su išsamiu tinklu 3 uostai, Puerto Rico gali pasigirti galinga jūrų infrastruktūra. Pagrindiniai šakotuvai, tokie kaip PONCE, Puerto Nuevo (PR), San Juan yra labai svarbūs tvarkant didžiulę prekybos apimtį, siūlydami įvairias logistines galimybes ir užtikrindami atsparų ryšį su tarptautinėmis laivybos juostomis visame pasaulyje.